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DATA_SCIENCE/Computer Vision

[REVIEW] U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation 리뷰, review

by HYUNHP 2023. 2. 12.
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안녕하세요, HELLO

 

이미지 분야 (computer vision)로 도메인 지식을 넓히기 위해, object detection, classification, segmentation, ocr, generative AI 등에 대해서 스터디를 진행하며, 논문을 리뷰하고 있습니다. 

 

이번에 살펴본 논문은 Semantic Segmentation 문제를 위해 제안된 딥러닝 모델인 U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation입니다.

 

U-Net은 Semantic Segmentation 모델을 위해 이미지 분류(Classification)에서 좋은 성능을 보인 CNN 기반 모델, Full Convolutional Network를 바탕으로, expansive path를 추가시킨 것입니다. 논문의 구조는 아래와 같이 정리할 수 있습니다.

 

  • Contracting Path: Convolution
  • Bottleneck: Path from contracting to expansive
  • Expansive Path: Concatenation with the correspondingly cropped feature map from the contracting path

 

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"U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation"과 관련하여, 자세히 정리된 논문 및 리뷰가 많기에, 논문을 공부하면서 궁금했던 내용을 문답 형식으로 정리했습니다.

그리고 논문 원본과 리뷰와 정리한 질의응답은 각각 PDF로 하단에 업로드했습니다.


Q1. 모델 정확도와 훈련 효율성 사이의 trade-off에서, 논문은 unpadding convolution을 사용하고 이를 어떻게 극복했나요?

 

A1. U-Net 아키텍처에서는 패딩을 사용하는 대신 stride가 2인 컨볼루션 레이어를 사용하여 feature map의 spatial dimension을 줄였습니다. 그 결과 입력 이미지의 대략적인 feature를 나타내는 다운 샘플링된 feature map이 생성됩니다.


다운 샘플링으로 인한 정보 손실을 극복하기 위해 다운 샘플링된 경로에서 해당 feature map과 결합되는 일련의 업 샘플링 레이어를 도입했습니다. 이를 통해 U-net은 입력 이미지의 공간 해상도와 세분화된 세부 정보를 복구할 수 있습니다. 이러한 방식으로 U-Net 아키텍처는 계산 효율성과 공간 정보 보존 사이의 균형을 유지하고, 입력 이미지의 정확한 분할을 가능하게 합니다.

Contracting Path는 입력 이미지를 다운 샘플링하고 Expansive path는 채널 수를 늘리면서 원래 크기로 업 샘플링합니다. Skip connections은 Contracting Path의 정보를 결합하여 분할 출력을 생성합니다. U-Net은 의료 영상에 널리 사용되었으며 3D 및 다중 모달 데이터용으로 확장되었습니다.


Q2. 논문에서 권장하는 unpadded 대신 convolution에서 padding을 사용하면 어떻게 될까요?

A2. 패딩 (padding)은 feature map의 spatial dimension을 유지하고, 정확한 분할에 중요할 수 있는 이미지 가장자리의 정보 손실을 방지하는 데 도움이 될 수 있습니다. 패딩을 사용하면 모델이 각 픽셀 주변의 더 많은 콘텍스트를 효과적으로 캡처할 수 있으므로, 세분화 예측의 정확도를 개선하는 데 도움이 될 수 있습니다. 그러나 패딩 사용의 계산 비용도 고려해야 합니다.

패딩은 모델의 메모리 요구 사항과 각 순방향 및 역방향 패스에 대한 계산 시간을 증가시킬 수 있으며, 이는 전체 훈련 시간에 상당한 영향을 미칠 수 있습니다. 따라서 U-Net 아키텍처에서 패딩을 사용할 때 정확도와 계산 비용 간의 균형을 신중하게 고려하는 것이 중요합니다.

계산 능력이 문제가 되지 않는 경우, 모델이 입력 이미지에 대한 더 많은 정보에 액세스 할 수 있으므로 U-Net에서 패딩을 사용하면 실제로 이미지 분할의 정확도가 향상될 수 있습니다. 그러나 계산 리소스가 제한되어 있는 경우 계산 효율성과 정확성 간의 균형을 유지하는, 원래 U-Net 아키텍처를 사용하는 것이 더 효율적일 수 있습니다.


Q3. Elastic deformation은 무엇입니까?

 


A3. Elastic deformation은 재료에 응력 (stress)이나 변형이 가해질 때 발생하는 변형입니다. 재료에 응력이 가해지면 적용된 응력에 비례하여 모양이나 크기가 변경됩니다. 그러나 일단 응력이 제거되면 재료는 원래 모양으로 돌아갑니다. 이러한 물질의 성질을 탄성이라고 하며, 응력을 받았을 때 물질에 작용하는 복원력의 결과입니다.

 

U-Net의 맥락에서 elastic deformation은 이미지 또는 이미지 내 객체의 변형과 관련하여 언급됩니다. 예를 들어 U-Net은 image segmentation에 적합한 모델로, 이미지가 변형되거나 뒤틀릴 때 모델이 정확한 segmentation을 할 수 있도록, 데이터를 추가하는 elastic deformation를 고려해야 할 수 있습니다.


Q4. 이미지 분할에서 elastic deformation이 유용한 이유는 무엇입니까?

A4. 지도 학습에서 elastic deformation이 유용할 수 있는 주된 이유 중 하나는 값비싼 라벨링 비용 때문입니다. 많은 애플리케이션에서 딥러닝 모델 훈련을 위해, 주석이 달린 데이터(annotated data)를 얻는 것은 시간이 많이 걸리고, 노동 집약적인 프로세스일 수 있습니다. 데이터에 레이블을 지정하려면 각 이미지를 수동으로 분할하고, 그 안에 있는 다른 개체에 레이블을 지정하는 인력이 필요합니다. 이 프로세스는 높은 수준의 정확도가 요구되고 데이터가 복잡하고 다중 모델일 수 있는 의료 영상의 경우 특히 어렵습니다.

elastic deformation을 사용하면 제한된 주석 이미지 집합에서 추가 주석 데이터를 생성할 수 있습니다. 원본 이미지에 작은 무작위 변형을 적용한 다음, 모델 훈련에 사용할 수 있는 새로운 주석 이미지를 생성하는 데 사용하는 것입니다. 이는 제한된 주석 데이터의 문제를 극복하고 입력 데이터의 작은 변화에 대한 모델의 견고성을 개선하는 데 도움이 될 수 있습니다.

즉, elastic deformation은 모델의 일반화 성능을 향상하는데 도움을 줄 수 있는 data augmentation 방법입니다. 다양한 변형 세트에 대해 모델을 교육함으로써 입력 데이터의 다양한 변형을 처리하고 보이지 않는 데이터에 대해 더 잘 일반화하는 방법을 학습할 수 있습니다.


Q5. Image segmentation에 유용한 정규화 방법 (normalization)는 무엇입니까?

A5. min-max scalingz-score sclaing 모두 장단점이 있으며, 정규화 방법의 선택은 특정 문제와 데이터의 특성에 따라 달라집니다. 예를 들어 min-max scaling은 이미지 분류 문제에 자주 사용되는 반면, z-score sclaing는 이미지 분할 및 객체 감지 문제에 사용됩니다.

min-max scaling을 통해 데이터를 [0, 1] 사이의 값으로 만들어서, 컴퓨터 연산을 빠르게 할 수 있으며 빛 번짐, 광원 등으로 인한 pixel intensity 등을 해결할 수 있습니다. 이러한 연산 속도의 향상과 pixel intensity 해결을 통해서, object detection에서 성능 향상을 이룰 수 있습니다.

 

평균과 표준 편차를 활용한, z-score scaling은 이미지 전체에서 균등하게 normalization 하는 min-max scaling보다 객체 (object) 간의 구분, 경계면을 명확하게 나눠줍니다. segmentation은 객체 간의 구분이 모델의 성능에 주요하게 작용함으로써, 이러한 z-score scaling은 segmentation task에서 성능 향상을 이룰 수 있습니다.


Recently, study object detection, classification, segmentation, OCR, etc of computer vision, and review related papers.

Reviewed the paper, "U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation", which is a deep learning architecture for image segmentation tasks that consists of a contracting path and an expansive path connected by skip connections to retain fine details.

The contracting path downsamples the input image and the expansive path upsamples it to the original size while increasing the number of channels. The skip connections combine information from the contracting path to produce a segmentation output. U-Net has been widely used in medical imaging and has been extended for 3D and multi-modal data.

 

  • Contracting Path: Convolution
  • Bottleneck: Path from contracting to expansive
  • Expansive Path: Concatenation with the correspondingly cropped feature map from the contracting path

 

 

■ ORIGINAL PAPER

U-Net, Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation.pdf
1.62MB

 

■ PAPER REVIEW

U-Net_review_hyunhp.pdf
1.39MB


■ 마무리

 

'U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation'에 대해서 알아봤습니다.

좋아요와 댓글 부탁드리며,
오늘 하루도 즐거운 날 되시길 기도하겠습니다 :)

 

감사합니다.

 

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